在沼气发酵系统里，无论是自然界还是在沼气池里，http://www.rtesen.com产酸菌与产甲烷菌都各自按照自己的遗传特征进行着代谢活动，他们之间又是相互制约，构成一套食物链，他们之间的相互关系主要表现为一下几个方面：
    产酸菌为产甲烷菌提供食物
    产酸菌把各种复杂的有机物，如碳水化合物、脂肪、蛋白质进行厌氧降解，生成游离氢、二氧化碳、氨、乙酸、甲酸、丙酸、甲醇、乙醇等产物，其中丙酸、乙酸、乙醇等又可被产氢菌产乙酸细菌转化为氢、二氧化碳、乙酸等。这样，产酸菌通过其生命活动为产甲烷细菌提供了合成细胞物质和甲烷所需的食物。
    产酸菌为产甲烷菌清除有毒物质
    在以工业废水或废弃物为发酵原料时，其中可能含有酚类、夲甲酸、氰化物、长链脂肪酸、重金属等对于产甲烷细菌有毒害作用的物质。产酸菌中有许多种类能裂解苯环从中获得能源和碳源，有些能以氰化物作为碳源，有些能降解长链脂肪酸，生成乙酸和较短链的脂肪酸。

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